有碧水丹山, 奇秀甲东南之称的武夷山不仅是著名的旅游胜地，也是我国亚热带完美生态系统的代表. 其地位与作为我国北方完美生态环境的代表的美丽的长白山相当.
我国是世界上最大的亚热带常绿阔叶林分布区, 武夷山地区拥有我国最大的亚热带常绿阔叶林, 这里的植被也是我国东南部保存最好的植被. 武夷山也有明显的植被垂直带. 除了亚热带常绿阔叶林外, 还有针叶阔叶混交林, 针叶林和次生的亚热带山地草甸. 许多珍贵的孑遗植物就生长其间.
武夷山的野生动物要更加著名. 这里有全国三分之一种类的鸟类, 其中的卦敦地区的鸟类尤其丰富, 被称为“鸟的王者”有40余种鸟类是在这里首先被发现命名的. 其中有白鹇, 黄嘴角鸮, 卦敦鸦雀, 白背啄木鸟等. 武夷山两栖动物和爬行动物也非常丰富, 共有100余种, 被誉为研究亚洲两栖动物和爬行动物的钥匙, 崇安髭蟾(武夷山角怪), 尖吻蝮(五步蛇), 大头平胸龟等都是武夷山有特色的动物. 武夷山大竹岚地区则是昆虫的王国, 这里发现了全国科数的三分之一. 其它动物还有黄腹角雉, 金猫, 云豹, 鬣羚等等.
从上世纪末开始, 各国探险家纷纷来此采集标本, 一百年来, 共发现了新种600余种, 成为世界闻名的模式标本产地, 全球最重要的基因库之一.
